現存する駅舎の中では最も古いもので、鉄道記念物に指定されています。当時高価だった煉瓦を節約するために、白い壁は無筋コンクリートで作られていますが、気品ある姿です。開業当時は敦賀から京都へ向かう枝線の終点で、鉄道から船への乗換駅だったために、待合室が広く作られています。現在は資料館となり、待合の様子が復原されています。
明治初年頃の駅は、旅客数が増えたり、設計が駅の機能を満足させられるものでなかったりしたことから、比較的早く建て替えられたものが多いのです。その点長浜駅は、現在は現役ではないものの立派だと思います。